Pracuje w Katedrze Prawa Europejskiego oraz Centrum Badań Ustroju Unii Europejskiej na Wydziale Prawa i Administracji Uniwersytetu Warszawskiego. Współpracuje z DELab UW, gdzie jest koordynatorką Pracowni badań nad zmianami regulacyjnymi na rynkach cyfrowych. Jest współredaktorką bloga poświęconego prawu międzynarodowemu przegladpm.blogspot.com. Pracę naukową łączy z pracą w Kancelarii Senatu RP jako analityczka w Biurze Spraw Międzynarodowych. Prowadzi badania dotyczące przede wszystkim prawa międzynarodowego gospodarczego oraz roli Unii Europejskiej jako specyficznego podmiotu międzynarodowych stosunków gospodarczych. W latach 2014–2015 była kierowniczką grantu NCN Sonata „Anatomia regionalnych umów handlowych. Co tak naprawdę ma znaczenie?" nr 2013/09/D/HS5/01328. Celem projektu była analiza umów handlowych Unii Europejskiej. W ostatnim okresie zakończyła grant OPUS pt. „Prawo międzynarodowe gospodarcze w czasie transformacji cyfrowej: trendy, modele regulacyjne oraz szczegółowe rozwiązania w zakresie e-handlu i danych" 2019/35/B/HS5/02107. Celem grantu była analiza nowych obszarów regulacyjnych w umowach handlowych związanych z rozwojem gospodarki cyfrowej. W badaniach, dzięki współpracy z w wykonawcą z Wydziału Nauk Ekonomicznych, zostały wykorzystane innowacyjne metody badawcze, czyli text mining. Część badań dr hab. Słok-Wódkowskiej w ostatnich latach była także poświęcona kwestiom czysto ustrojowym Unii Europejskiej, takim jak rola Parlamentu Europejskiego oraz parlamentów narodowych państw członkowskich.
